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Histologie virtuelle

6 Octobre 2015


Catégorie : Soutenance de thèse


Soutenance de thèse d'Hugo ROSITI intitulée "APPROCHE INFORMATIONNELLE DE L’IMAGERIE DE CONTRASTE DE PHASE PAR RAYONNEMENT SYNCHROTRON. APPLICATIONS PRÉCLINIQUES À L’IMAGERIE DU CERVEAU DU PETIT ANIMAL"

CREATIS, Lyon

le VENDREDI 23 OCTOBRE À 14H
dans l'amphithéâtre Est du bâtiment des Humanités, de l'INSA de Lyon sur le campus de la DOUA.

Contact : david.rousseau@univ-lyon1.fr

 

Vous êtes cordialement invités à la soutenance de thèse d'Hugo ROSITI intitulée "APPROCHE INFORMATIONNELLE DE L’IMAGERIE DE CONTRASTE DE PHASE PAR RAYONNEMENT SYNCHROTRON. APPLICATIONS PRÉCLINIQUES À L’IMAGERIE DU CERVEAU DU PETIT ANIMAL".

La soutenance aura lieu le VENDREDI 23 OCTOBRE À 14H dans l'amphithéâtre Est du bâtiment des Humanités, de l'INSA de Lyon sur le campus de la DOUA.

David ROUSSEAU

Le jury sera composé de :

  • Alain Dieterlen, Professeur des Universités, Université de Haute Alsace (rapporteur)
  • Daniel Sage, Chercheur, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL) (rapporteur)
  • Jean-Christophe Olivo-Marin, Directeur de recherche, Institut Pasteur, Paris
  • Françoise Peyrin, Directeur de recherche, Inserm, CREATIS/ESRF, Grenoble (invitée)
  • Marlène Wiart, Directeur de recherche, CNRS, CREATIS
  • Carole Frindel, Maitre de conférence, INSA LYON, CREATIS
  • David Rousseau, Professeur des Universités, Université Lyon 1,CREATIS

Résumé :

L’histologie virtuelle est un domaine qui suscite un intérêt de recherche croissant. Nous nous intéressons à une de ces techniques en particulier via l’imagerie de contraste de phase par rayonnement synchrotron. Cette imagerie nous permet d’observer des cerveaux de souris intacts avec une résolution spatiale de 8µm isotropique, soit une résolution similaire à celle d’une histologie optique classique mais sans endommager les tissus par des colorations ou des marquages spécifiques. Ces travaux de thèse sont organisés autour de trois grands axes. Un premier axe présente l’instrumentation photonique qui permet l’obtention du contraste de phase et le paramétrage original qui est proposé pour l’acquisition d’échantillons biologiques de composition hétérogène. Un second axe présente différents traitements d’images développés pour des tâches informationnelles précises telles que l’optimisation de la visualisation, la détection d’agrégats cellulaires et la tractographie de structures fibreuses. Enfin, une application biomédicale de ces traitements est proposée via la détection et la quantification de nanoparticules d’oxyde de fer dans un modèle expérimental d’accident vasculaire cérébral.