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Journées d'imagerie optique non conventionnelle - 9e édition

Nous vous rappelons que, afin de garantir l'accès de tous les inscrits aux salles de réunion, l'inscription aux réunions est gratuite mais obligatoire.

Inscriptions closes à cette réunion.

Inscriptions

48 personnes membres du GdR ISIS, et 50 personnes non membres du GdR, sont inscrits à cette réunion.
Capacité de la salle : 100 personnes.

Instructions pour une demande de mission par le GdR ISIS

Le GdR ISIS prend en charge les déplacements des organisateurs des réunions et des orateurs. Le GdR prend aussi en charge les déplacements des participants aux réunions membres d'un laboratoire adhérent du GdR dans la limite d'un doctorant et d'un permanent par laboratoire académique et par réunion, ou d'une personne par adhérent du club des partenaires et par réunion.

La plus grande partie du budget du GdR ISIS est consacrée à la prise en charge de ces missions. Pour que le GdR puisse financer le plus grand nombre de réunions, les participants à ces réunions sont vivement incités à choisir les billets les moins chers. Seuls les billets de train ou d'avion en deuxième classe, non échangeables et non remboursables sont pris en charge. Le GdR se réserve le droit de refuser une demande de billet dont le prix excède la moyenne des prix couramment pratiqués pour le trajet de la mission.

Pour le transport et pour l'hébergement, vous êtes priés d'utiliser le portail SIMBAD du CNRS si vous en avez la possibilité. Cela est en particulier obligatoire si vous êtes membre d'une unité CNRS (UPR, UMR, UMI, URA, FRE). Les réservations d'hôtel sont possibles si la réunion dure plus d'une journée ou si le lieu d'habitation le justifie. Dans le cas où le laboratoire n'est pas une unité CNRS, merci d'envoyer votre demande de prise en charge de la mission à l'adresse DR01.SoutienUnites@cnrs.fr en précisant que la mission relève du GdR ISIS. Si vous utilisez votre véhicule personnel pour une distance supérieure à 300 kilomètres (aller+retour), le GdR ISIS ne rembourse pas vos frais de transport.

Les demandes de mission et les réservations sur le site SIMBAD doivent impérativement être effectuées au moins deux semaines avant la date de la mission.

Aucun remboursement de frais de transport ou d'hôtel avancés par l'agent ne peut plus être effectué au retour de la mission.

Annonce

 

Plus que jamais, le domaine de l’imagerie optique se situe au carrefour de plusieurs disciplines, tant du point de vue de la conception des systèmes, mêlant physique, conception optique et traitement des images, qu'en termes d'applications: biomédical, télédétection, astronomie, ...

Les « Journées Imagerie Optique Non-Conventionnelle » (JIONC) visent à réunir les acteurs (chercheurs et ingénieurs) de ces différents domaines, afin d'échanger sur les plus récents développements de systèmes ou de traitements pour l'imagerie « non-conventionnelle » et d’évaluer leurs applications potentielles. 

Bien qu’organisées dans la continuité des éditions précédentes, les JIONC évoluent néanmoins en 2014 en se dotant d'un comité d'organisation et d'un comité de programme renouvelés, visant toujours à refléter la diversité thématique des communautés de l'imagerie optique et du traitement du signal/image.

Cette année, nous accueillerons deux présentations invitées données par :

Nous sollicitons des propositions de communications de nature théorique et applicative, provenant des milieux académiques et industriels, sur les thèmes suivants (liste non exhaustive) :

Merci de nous faire parvenir vos propositions (max. 1 page par résumé), par courrier électronique, avant le 1er février 2014.

aux coordonnées suivantes :

Comité de programme

Programme

 Durée pour chaque contribution orale : 15 min + 5 min questions

Mercredi 19 mars

10H-10H45 : CONFERENCE INVITEE

 « Phase retrieval in X-ray in-line phase tomography - developments and applications »
Max Langer CREATIS,
Univ. Lyon 1, CNRS, INSERM, Lyon European Synchrotron Radiation Facility (ESRF), Grenoble

10H45-12H05 : IMAGERIE HAUTES-ENERGIES

 « A new microscopy for imaging crystalline properties in 3D at the nanoscale: Bragg X-ray ptychography »
V. Chamard, M. Allain
Institut Fresnel, CNRS, Aix-Marseille Université, Ecole Centrale Marseille, Marseille

« Tomographie de phase par rayonnement synchrotron appliquée à la détection de nanoparticules dans le cerveau »
H. Rositi, C. Frindel1, M. Langer1,2, M. Wiart1, C. Olivier1,2, F. Peyrin1,2, D. Rousseau1
(1) CREATIS, Univ. Lyon 1, CNRS, INSERM, Lyon
(2) European Synchrotron Radiation Facility (ESRF), Grenoble

« Phase retrieval in Bragg-diffraction ptychography: noise models and reconstruction algorithms »
M. Allain1, P. Godard1;2, A. Pateras1, F. Mastropietro1, V. Chamard1
(1) Institut Fresnel, CNRS, Aix-Marseille Université, Ecole Centrale Marseille, Marseille
(2) Université de Poitiers, CNRS, ENSMA, Institut P', UPR 3346, Poitiers

« Bimodalité en tomographie Compton »
G. Rigaud1, R. Régnier2, M. K. Nguyen2
(1) Institute of Applied Mathematics, Saarland University, Saarbrücken, Germany
(2) ETIS - ENSEA/Université de Cergy-Pontoise/CNRS (UMR 8051), Cergy-Pontoise

12h05-14h00 : DEJEUNER

14H00-15H20 : TOMOGRAPHIE DIFFRACTIVE ET HOLOGRAPHIE NUMERIQUE

« Microscopie Tomographique Diffractive en reflexion et profilométrie multiangles »
L. Hui, J. Bailleul, B. Simon, M. Debailleul, B. Colicchio, O. Haeberle
Laboratoire MIPS, Universite de Haute Alsace, Mulhouse

« Microscopie Tomographique Diffractive résolue en polarization : vers une résolution sub lambda/4 »
C. Godavarthi1, T. Zhang1, G. Maire1, H. Giovannini1, P. C. Chaumet1, A. Talneau2, K. Belkebir1, A. Sentenac1
(1) Institut Fresnel, CNRS, Aix-Marseille Université, Ecole Centrale Marseille, Marseille
(2) Laboratoire de Photonique et de Nanostructures, CNRS, Marcoussis

« Stochastic near field 3D microscopy using Brownian metallic nanoparticles »
A. Martinez-Marrades1, N. Bardou2, S. Collin2, M. Gross3, F. Kanoufi4,5, G. Tessier1,6
(1) Institut Langevin, ESPCI ParisTech, CNRS, Université Pierre et Marie Curie, Paris
(2) Laboratoire Photonique et Nanostructures (LPN-CNRS), Marcoussis
(3) Laboratoire Charles Coulomb-UMR, 5221 CNRS-UM2, Université Montpellier II, Montpellier
(4) Univ. Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, ITODYS, UMR CNRS 7086, Paris
(5) ESPCI ParisTech, Paris
(6) Neurophotonics Laboratory, CNRS UMR 8250, University Paris Descartes, Paris

« Visualisation des courants de convection dans une ampoule par interférométrie holographique image et numérique »
J-M. Desse1, P. Picart2
(1) ONERA The French Aerospace Lab, Lille
(2) LUNAM Université, Université du Maine, CNRS UMR 6613, LAUM, Le Mans

15H20-16H40 : PROBLEMES INVERSES

 « Une nouvelle approche régularisée pour la reconstruction de phase »
A. Repetti, E. Chouzenoux, J-C. Pesquet
Equipe signal et communication, LIGM, Université de Marne-la-Vallée

« Approche Bayésienne pour l'optimisation de la Microscopie par Illumination Structurée »
F. Orieux1, E. Sepulveda2, V. Loriette3, J.-C. Olivo-Marin4, A. Fragola3
(1) IAP, CNRS, Paris
(2) IN2P3, Paris VI, Paris
(3) LPEM, CNRS, ESPCI-Paris-Tech, Paris
(4) QIAU, Institut Pasteur, CNRS

« Approche Bayésienne faiblement régularisée pour la super-résolution en microscopie de fluorescence basée sur la diffraction conique »
J. Caron1, C. Fallet1, J-Y. Tinevez2, L. Moisan3, L. Philippe (Ori) Braitbart1, Gabriel Y. Sirat1 and Spencer L. Shorte2
(1) Bioaxial SAS, Paris
(2) PFID, Imagopole, Institut Pasteur, Paris
(3) Universite Paris Descartes, Laboratoire MAP5, Paris

« Contrôle de front-d’onde extrême pour l’imagerie astronomique à haute dynamique : premiers résultats experimentaux »
B. Paul1,3, J-F. Sauvage1,2, L. Mugnier1, D. Mouillet2, K. Dohlen3, T. Fusco1,3, M. Ferrari3
(1) Onera The French Aerospace Lab, Châtillon
(2) Institut de Planétologie et d’Astrophysique de Grenoble
(3) Laboratoire d’Astrophysique de Marseille

 

16h40-... -- PAUSE CAFE ET 1ERE SESSION POSTERS

Jeudi 20 mars

8h45-9h30 -- CONFERENCE INVITEE

 « Wave front shaping and optogenetics »
Valentina Emiliani
Wave front engineering microscopy group, Neurophotonics Laboratory,  CNRS UMR8250, Paris Descartes University, Paris

9h30-10h50 -- NOUVEAUX CONCEPTS EN IMAGERIE I

 « Vidéo-microscopie sans lentille appliquée à l'étude de cultures 2D de cellules »
O. Cioni, F. Momey, S. V. Kesavan, J.-G. Coutard, F. Navarro, C.P. Allier, J.-M. Dinten
CEA, Leti, Campus Minatec, Grenoble

« Laser Doppler holographic microscopy in transmission: in-vivo imaging of zebrafish embryo »
N. Verrier1,2, D. Alexandre1 , M. Gross2
(1) Laboratoire Hubert Curien, UMR CNRS-5516 Université Jean Monnet, Saint-Etienne
(2) Laboratoire Charles Coulomb, UMR CNRS-5221 Université de Montpellier II, Montpellier

« Polarimetrie de Mueller déportée par fibre optique »
S. Manhas1, J. Vizet1, S. Deby2, J.-C. Vanel2, A. De Martino2, D. Pagnoux1
(1) Institut Xlim, département photonique, Limoges, France
(2) LPICM, UMR CNRS 7647, Ecole Polytechnique, Palaiseau

« Améliorer la vivisilité en imagerie photoacoustique en utilisant une illumination structurée aléatoirement »
J. Gateau, T. Chaigne, O. Katz, S. Gigan, E. Boissy
Institut Langevin, ESPCI ParisTech, CNRS UMR 7587, INSERM U979, Paris

10h50-12h10 -- PAUSE CAFE ET 2E SESSION POSTERS 

12h10-14h00 -- DEJEUNER  

14h00-15h40 -- IMAGERIE HYPER- ET MULTI-SPECTRALE

 « Système hyperspectral pour la visualisation rehaussée de tissus vitaux en imagerie interventionnelle »
D.Nouri, Y. Lucas, S. Treuillet
Laboratoire PRISME, Université d'Orleans, Orléans

« Modélisation de la réponse hyperspectrale des matrices de détecteurs infrarouges »
S. Mouzali, S. Lefebvre
ONERA The French Aerospace Lab, Palaiseau

« Hyperspectral Image Classification Using Sparse Representations of Morphological Attribute Profiles »
M. Dalla Mura1, S. Benqin2, J. Li3, P. Li2, A. Plaza3, J. Bioucas Dias4, J.A. Benediktsson5, J. Chanussot1
(1) Grenoble Institute of Technology (INP Grenoble), GIPSA-Lab, Grenoble
(2) Peking University, Institute of Remote Sensing and GIS, China
(3) University of Extremadura, Dpt. of Technology of Computers and Communications, Spain
(4) Instituto de Telecomunicacoes, Electro. and Comp., Portugal
(5) University of Iceland, Engineering Research Institute, Iceland

« Tomographie par cohérence optique plein champ multi-bandes sur une plage spectrale s'étendant de 530nm à 1700nm »
A. Federici, A. Dubois
Laboratoire Charles Fabry, CNRS UMR 8501, Institut d'Optique Graduate School, Univ. Paris-Sud, Palaiseau

15h40-17h00 -- NOUVEAUX CONCEPTS EN IMAGERIE II

 « Reconstruction 3D des faces externes et internes d'objets transparents par polarimétrie »
F. Drouet, C. Stolz, O. Laligant, O. Aubreton
Le2i, Université de Bourgogne, UMR CNRS 6306, Le Creusot

« Evaluation des performances des techniques de profilométrie de surface par des mesures multi-modales et marquage sur silicium »
P.C. Montgomery1, M. Guellil1, P. Pfeiffer1, B. Serio2
(1) Laboratoire des Sciences de l'Ingénieur, de l'Informatique et de l'Imagerie (ICube), Unistra-CNRS, UMR 7357, Strasbourg
(2) Laboratoire Energétique, Mécanique, Electromagnétisme (LEME), Université Paris Ouest Nanterre La Défense, Ville d'Avra
y

« Mapping the radiative and non-radiative local density of states with a fluorescent scanning near-field probe »
D. Cao1, A. Cazé1, M. Calabrese1, R. Pierrat1, N. Bardou2, S. Collin2, R. Carminati1, V. Krachmalnicoff1, Y. De Wilde1
(1) Institut Langevin, ESPCI ParisTech, CNRS UMR 7587, Paris
(2) Laboratoire de Photonique et Nanostructures (LPN-CNRS), Marcoussis

« Un imageur compressé utilisant les milieux multiplement diffusants »
A. Liutkus1, D. Martina1, S. Popoff1, G. Chardon2, O. Katz1, G. Lerosey1, S. Gigan1, L. Daudet1, I. Carron3
(1) Institut Langevin, ESPCI ParisTech, CNRS UMR 7587, Paris
(2) Acoustics Research Institute, Vienna, Austria
(3) TEES SERC, Texas A&M University, USA

Posters

 
01 - « Aberrométrie à haute résolution temporelle »
S. Meimon1, J. Jarosz1,2, J. M. Conan1, M. Paques2
(1) ONERA, Chatillon
(2) Quantel Medical, Cournon d'Auvergne (3) Centre Investigation clinique 503, INSERM, Hôpital des Quinze-Vingts, Paris
02 - « Vers un endomicroscope non-linéaire multimodal : caractérisation, comparaison et choix d'une fibre endomicroscopique à double gaine »
C. Lefort1,2, H. Hamzeh1,5, F. Louradour2,3, F. Pain1,5 and D. Abi Haidar1,4
(1) Laboratoire IMNC, UMR 8165- Université Paris-Sud Orsay
(2) Université de Limoges, Limoges
(3) Laboratoire XLIM, UMR 7252, Limoges
(4) Université Paris 7-DENIS DIDEROT, Paris
(5) Université Paris Sud Orsay, Orsay
03 - « Polarized fluorescence and nonlinear microscopy: probing lipids organization in cell membranes and biological tissues »
P. Gasecka, F.-Z. Bioud, H. Rigneault, P. Ferrand, J. Duboisset, S. Brasselet
Institut Fresnel, CNRS, Aix-Marseille Université, Ecole Centrale Marseille, Domaine Universitaire St Jérôme, Marseille
04 - « Phase extraction through multi-step vortex filtering »
Alberto Aguilar1,2 , Abundio Dávila1, Jorge García-Márquez3, Cyril Mauclair2
(1) Centro de Investigaciones en Optica, León, México
(2) Laboratoire Hubert Curien, UMR 5516 CNRS, Université Jean Monnet, Saint Etienne
(3) Laboratoire Commun de Métrologie LNE/CNAM, Paris
05 - « Optimisation of acquisition conditions for X -ray phase micro-tomography »
T. Frachon3,4, L. Weber1,2, B. Hesse1,2, P. Dong1,2, S. Rit1,2, F. Peyrin1,2, M. Langer1,2
(1) Créatis, CNRS UMR5220, Inserm U1044, INSA-Lyon, Université Lyon 1, Villeurbanne.
(2) European Synchrotron Radiation Facility (ESRF), Grenoble
(3) LMGP, UMR 5628, Grenoble INP, Minatec, Grenoble
(4) EVEON SAS, Montbonnot Saint-Martin
06 - « Comparison of regularized phase retrieval algorithms for X-ray phase contrast tomography: application on experimental data »
L. Weber1,2, M. Langer1,2, P. Cloetens2, F. Peyrin1,2
(1) Créatis, CNRS UMR5220, Inserm U1044, INSA-Lyon, Université Lyon 1, Villeurbanne
(2) European Synchrotron Radiation Facility (ESRF), Grenoble
07 - « Adaptive Optics retinal images registration in SLO eye fundus images »
R. Fezzani1,2, P. Cornic2, G. Le Besnerais2, C. Kulcsar1
(1) ONERA The French Aerospace Lab, Palaiseau
(2) Laboratoire Charles Fabry, Institut d'Optique Graduate School, CNRS, Univ. Paris-Sud, Palaiseau
08 - « De l'imagerie directe au Machine Learning ... et plus, en 15 minutes »
Igor Carron
TEES SERC, Texas A&M University, USA.
09 - « Algorithme de segmentation d'images bruitées ultra-rapide et non supervisé : apport pour la conception de systèmes de traitement d'image »
S. Liu, F. Galland, N. Bertaux
Aix Marseille Université, CNRS, Centrale Marseille, Institut Fresnel, UMR 7249, Marseille
10 - « Analyse d'hologrammes par approche "problèmes inverses" pour l'étude des écoulements confinés »
N. Verrier , C. Fournier , L. Denis , T. Fournel
Laboratoire Hubert Curien, UMR CNRS-5516 Université Jean Monnet, Saint-Etienne
11 - « Microscopie tomographique diffractive en résolution isotrope »
J. Bailleul, L. Hui, B. Simon, M. Debailleul, B. Colicchio, O. Haeberle
Laboratoire MIPS EA2332, Universite de Haute Alsace, Mulhouse
12 - « Contrôler de façon non invasive la lumière dans les milieux diffusants grâce à la matrice de transmission photoacoustique »
T. Chaigne, O. Katz, J. Gateau, C. Boccara, M. Fink, E. Bossy, S. Gigan
Institut Langevin, ESPCI, Paris
13 - « Etude expérimentale de fantômes bi-modalités en imagerie photoacoustique multispectrale »
M. Vallet1, F. Varray1, B. Montcel1, J. Boutet2, D.Vray1
(1) CREATIS, CNRS UMR5220, Inserm U1044, INSA-Lyon, Université Lyon 1
(2) CEA-LETI, MINATEC, Grenoble
14 - « Microscopie photoacoustique avec résolution optique: nouvelle approche endoscopique »
O. Simandoux1, I.N. Papadopoulos2, S. Farahi2, J.P. Huignard1, D. Psaltis2, C. Moser2 et E. Bossy1
(1) Institut Langevin, ESPCI, CNRS UMR 7587, INSERM ERL U979, 75005 Paris
(2) School of Engineering, Ecole Polytechnique Fédéral de Lausanne (EPFL), Lausanne, Suisse
15 - « Refocalisation numérique en tomographie par cohérence optique plein champ avec une source à faible cohérence spatiale »
A. Grebenyuk1 , A. Federici2, V. Ryabukho1,3, A. Dubois2
(1) Department of Optics and Biophotonics, Saratov State University, Saratov, Russia
(2) Laboratoire Charles Fabry, Institut d'Optique Graduate School, CNRS UMR 8501, Université Paris-Sud, Palaiseau
(3) Institute of Precision Mechanics and Control, Russian Academy of Sciences,Saratov, Russia
16 - « Infrared near-field imaging and spectroscopy with broadband sources »
F. Peragut, J.-B. Brubach, P. Roy, Y. De Wilde
Institut Langevin, ESPCI ParisTech, CNRS, Paris
17 - « Réalisation d'un imageur bas coût ultra-compact à base d'optiques planaires »
T. Grulois1, G. Druart1, N. Guérineau1, A. Crastes2
(1) ONERA The French Aerospace Lab, Palaiseau
(2) ULIS, ZI Les Iles Cordées, Veurey-Voroize
18 - « Towards Characterization of Camera Lenses with Light Field Sensors »
J. Restrepo1,2 , and I. Ihrke1,2
(1) INRIA Bordeaux Sud-Ouest
(2) Laboratoire Photonique, Numérique et Nanosciences, Institut d'Optique Graduate School, Univ. Bordeaux 1
19 - « Mesure spatialement résolue des paramètres de polarisation d'un champ de speckle »
A. Ghabbach, M. Zerrad, G. Soriano, C. Amra
Institut Fresnel, CNRS UMR 7249, Aix Marseille Université, Ecole Centrale Marseille, Marseille
20 - « Etude de la polarimétrie du speckle pour la discrimination entre diffusions surfacique et volumique »
J. Dupont1, X. Orlik1, A. Ghabbach2, M. Zerrad2, G. Soriano2, C. Amra2
(1) ONERA The French Aerospace Lab, Toulouse
(2) Institut Fresnel, CNRS UMR 7249, Aix Marseille Université, Ecole Centrale Marseille, Marseille
21 - « Performances optimales d'estimation en imagerie polarimétrique en présence de fluctuations de bruit corrélées »
J. Fade, S. Panigrahi, M. Alouini
Institut de Physique de Rennes, Université de Rennes 1, CNRS, Rennes
22 - « Imagerie polarimétrique à longue distance à travers le brouillard »
S. Panigrahi1, J. Fade1, A. Carré1, C. Hamel1, L. Frein1, F. Bretenaker2, H. Ramachandran3, M. Alouini1
(1) Institut de Physique de Rennes, Université de Rennes 1, CNRS, Rennes
(2) Laboratoire Aimé Cotton, CNRS, Université Paris-Sud 11, Orsay
(3) Raman Research Institute, Bangalore, India
 
 
 
 

 

Résumés des contributions

 

EXPOSES INVITES

« Phase retrieval in X-ray in-line phase tomography - developments and applications »
Max Langer
CREATIS, Univ. Lyon 1, CNRS, INSERM, Lyon
European Synchrotron Radiation Facility (ESRF), Grenoble

 

Propagation-based, or in-line, phase contrast imaging is a simple way to achieve phase contrast with hard X-rays. It has gained increasing interest due to the potentially three orders of magnitude increase in sensitivity compared to attenuation based imaging. One of the most interesting aspects of in-line phase contrast, however, is that there exists a quantitative relationship between the mass density distribution in the imaged object and the recorded intensity. This allows the reconstruction of the phase shift induced by the object through a process known as phase retrieval. Since the phase can be considered a straight line projection, access to the phase shift allows 3D reconstruction of the complex refractive index. This talk outlines our contributions to the methodology of phase tomography on the level of the mathematical modelling and regularization. Further, we present several applications of the technique in biomedical imaging with synchrotron radiation. Special attention is given to the investigation of bone tissue at the micro and nano scale on images acquired at the ID19 and ID22 beamlines at the ESRF.

 

«Wave front shaping and optogenetics»
Valentina Emiliani
Wave front engineering microscopy group, Neurophotonics Laboratory, CNRS UMR8250, Paris Descartes University, Paris

 

The combination of light microscopy and optogenetics offers the possibility to control activation and inhibition of neuronal activity enabling the analysis of well-defined neuronal population within intact neuronal circuits and systems. Interestingly, optogenetics has already permitted to address key biological questions with relatively simple illumination methods using widefield visible light illumination. However, some limitations in the specificity of genetic targeting and the intricate morphology of the brain make it challenging to, for example, individuate subsets of genetically identical interconnected cells, or to establish the role of specific spatiotemporal excitatory patterns in guiding animal behavior. To reach such degree of specificity, more sophisticated illumination methods are required. Here we present a new method for high-resolution two photon optogenetics based on the temporal control of ultrafast pulses for axial localization of the illumination volume and on either digital holography or the generalized phase contrast method for lateral light patterning. We apply sculpted two-photon illumination to activate ChR2 in cultured neurons and cortical slices with sufficient efficacy to reliably fire action potentials with millisecond temporal resolu­tion and low excitation power. Finally, we investigate the propagation of temporally focused patterned beams through thick fixed and acute brain slices and demonstrate that both axial resolution and lateral light shape of temporally focused beams are impressively robust to scattering.

 

Date : du 2014-03-19 au 2014-03-20

Lieu : ESPCI, 10 rue Vauquelin, Paris


Thèmes scientifiques :
B - Image et Vision

Inscriptions closes à cette réunion.

Accéder au compte-rendu de cette réunion.

(c) GdR 720 ISIS - CNRS - 2011-2015.