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Journées Imagerie Optique Non Conventionnelle - 11 ème édition

Nous vous rappelons que, afin de garantir l'accès de tous les inscrits aux salles de réunion, l'inscription aux réunions est gratuite mais obligatoire.

Inscriptions closes à cette réunion.

Inscriptions

60 personnes membres du GdR ISIS, et 81 personnes non membres du GdR, sont inscrits à cette réunion.
Capacité de la salle : 150 personnes.

Instructions pour une demande de mission par le GdR ISIS

Le GdR ISIS prend en charge les déplacements des organisateurs des réunions et des orateurs. Le GdR prend aussi en charge les déplacements des participants aux réunions membres d'un laboratoire adhérent du GdR dans la limite d'un doctorant et d'un permanent par laboratoire académique et par réunion, ou d'une personne par adhérent du club des partenaires et par réunion.

La plus grande partie du budget du GdR ISIS est consacrée à la prise en charge de ces missions. Pour que le GdR puisse financer le plus grand nombre de réunions, les participants à ces réunions sont vivement incités à choisir les billets les moins chers. Seuls les billets de train ou d'avion en deuxième classe, non échangeables et non remboursables sont pris en charge. Le GdR se réserve le droit de refuser une demande de billet dont le prix excède la moyenne des prix couramment pratiqués pour le trajet de la mission.

Pour le transport et pour l'hébergement, vous êtes priés d'utiliser le portail SIMBAD du CNRS si vous en avez la possibilité. Cela est en particulier obligatoire si vous êtes membre d'une unité CNRS (UPR, UMR, UMI, URA, FRE). Les réservations d'hôtel sont possibles si la réunion dure plus d'une journée ou si le lieu d'habitation le justifie. Dans le cas où le laboratoire n'est pas une unité CNRS, merci d'envoyer votre demande de prise en charge de la mission à l'adresse DR01.SoutienUnites@cnrs.fr en précisant que la mission relève du GdR ISIS. Si vous utilisez votre véhicule personnel pour une distance supérieure à 300 kilomètres (aller+retour), le GdR ISIS ne rembourse pas vos frais de transport.

Les demandes de mission et les réservations sur le site SIMBAD doivent impérativement être effectuées au moins deux semaines avant la date de la mission.

Aucun remboursement de frais de transport ou d'hôtel avancés par l'agent ne peut plus être effectué au retour de la mission.

Annonce

Rappel : Derniers jours pour s'inscrire avant le 14 Mars.

Ces dernières années, le domaine de l'imagerie optique a connu des progrès conceptuels et technologiques importants, en rupture avec les approches « conventionnelles » de conception des systèmes. Parmi ces aboutissements remarquables figurent les avancées en imagerie super-résolue, imagerie 3D, imagerie quantitative, ou encore en détection comprimée (compressive sensing). Ces progrès sont rendus possibles par la miniaturisation et la démocratisation des capacités de calcul information, mais surtout grâce à l'interaction toujours plus grande entre la conception optique, le traitement du signal et des images, et le développement de nouvelles technologies de capteurs.

À l'interface de ces thématiques, les « Journées Imagerie Optique Non-Conventionnelle » (JIONC) visent depuis plus de 10 ans à réunir les acteurs nationaux (chercheurs et ingénieurs) de ces différents domaines, afin d'échanger sur les plus récents développements de systèmes ou de traitements pour l'imagerie « non-conventionnelle » et d'évaluer leurs applications potentielles.

Cette année, nous accueillerons deux présentations invitées données par :

Nous vous rappelons que, afin de garantir l'accès de tous les inscrits à l'amphithéâtre, l'inscription aux réunions est gratuite mais obligatoire sur le site du GDR ISIS:

http://www.gdr-isis.fr/index.php?page=reunion&idreunion=295

Suite au renforcement des mesures de sécurité, l'accès à l'ESPCI sera strictement réservé aux personnes inscrites au préalable sur le site du GDR ISIS avant le 14 Mars.

Merci par ailleurs de limiter vos bagages au maximum pour faciliter l'accès

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Programme

Durée pour chaque contribution orale : 15 min + 5 min de questions

Mercredi 16 mars

9h45-10H00 : ACCUEIL - INTRODUCTION

10H00-10H50 : CONFERENCE INVITEE


« Mathematical microscopy »

Jean-Christophe Olivo-Marin
Institut Pasteur, CNRS URA 3691, Paris
--> Résumé en fin de programme


10H50-12H10 : RECONSTRUCTION
« Sparse deconvolution of high-density images in wide-field super-resolution microscopy »
Siewert Hugelier1, Johan J. de Rooi2, Michel Sliwa1, Peter Dedecker3, Paul H. C. Eilers2, Cyril Ruckebusch1
(1) Université de Lille, LASIR CNRS UMR 8516, Lille
(2) Erasmus MC, Department of Biostatistics, Rotterdam, the Netherlands
(3) Department of Chemistry, KU Leuven, Belgium


« Super-resolution capacity of imagers using random illuminations »
Simon Labouesse1, Marc Allain1, Jérôme Idier2, Sébastien Bourguignon2, Penghuan Liu2, Anne Sentenac1
(1) Aix-Marseille Université, CNRS, Centrale Marseille, Institut Fresnel UMR 7249, Marseille
(2) L'UNAM Université, École Centrale de Nantes, CNRS, IRCCyN, UMR 6597, Nantes

« Reconstruction d'intensité dans une expérience de diffraction de particule unique : une approche par géométrie sphérique. »
Julien Flamant1,3, Nicolas Le Bihan2,3, Andrew V. Martin3, Jonathan H. Manton3
(1) Univ. Lille, CNRS, Centrale Lille, UMR 9189 - CRIStAL, Lille
(2) CNRS, GIPSA-Lab, St Martin d'Heres
(3) The University of Melbourne, Melbourne, Australia

« Acquisition adaptative pour single-pixel caméra : comparaison avec l?acquisition comprimée »
Florian Rousset1,2, Nicolas Ducros1, Andrea Farina2, Cosimo D'Andrea2, Françoise Peyrin1
(1) CREATIS, Université de Lyon, CNRS UMR5220, Inserm U1206, INSA Lyon - Villeurbanne
(2) Politecnico di Milano, Dipartimento di Fisica - Milan, Italie


12H10-14H00 : DEJEUNER



14H00-14H30 : FOCUS (25 min + 5 min de questions)


« Ressources quantiques et traitement numérique des images »
François Chapeau-Blondeau, Étienne Belin
Laboratoire Angevin de Recherche en Ingénierie des Systèmes (LARIS), Université d?Angers, Angers

14H30-15H10 : MICROSCOPIE SANS LENTILLE

« Microscopie sans lentille RGB : reconstruction par approche problèmes inverses »
Nicolas Verrier1,2, Corinne Fournier1, Frédéric Jolivet1, Loïc Denis1
(1) Université Jean Monnet de Saint-Etienne, CNRS UMR5516, Laboratoire Hubert Curien, Saint-Etienne
(2) Université de Lyon, Observatoire de Lyon, CNRS, UMR 5574, Centre de Recherche Astrophysique de Lyon, St-Genis Laval


« Imagerie sans lentille de lames de tissus colorés et transparents »
Sophie Morel1, Lionel Hervé1, Thomas Bordy1, Olivier Cioni1, Antoine Delon2, Catherine Fromentin3, Jean- Marc Dinten1, Cédric Allier1
(1) Univ. Grenoble Alpes, CEA, LETI, MINATEC Campus, Technologies for Healthcare and Biology division, Grenoble
(2) Univ. Grenoble Alpes, LIPhy, CNRS, Grenoble
(3) Laboratoire d?Anatomocytopathologie, Centre Hospitalier Dr. Schaffner, Lens


15H10-15H30 : PAUSE CAFE - Salle Champetier, ESPCI


15H30-17H10 : IMAGERIES POLARIMETRIQUES


« Étude polarimétrique de champs de speckle : caractérisation des matériaux via leur pouvoir de décorrélation »
Xavier Orlik, Jan Dupont
ONERA, Theoretical and Applied Optics Department, Toulouse

« Méthode différentielle à deux longueurs d'ondes pour la réalisation d'images polarimétriques de Mueller à travers une fibre optique endoscopique »
Jérémy Vizet1,2, Sandeep Manhas1,2, Jacqueline Tran1, Pierre Validire3, Abdelali Benali3, Enric Garcia-Caurel1, Angelo Pierangelo1, Antonello de Martino?, Dominique Pagnoux2
(1) LPICM, CNRS, Ecole Polytechnique, Université Paris Saclay, Palaiseau
(2) Université de Limoges, CNRS, XLIM UMR 7252, Limoges
(3) Institut Mutualiste Montsouris, département d'anatomopathologie, Paris


« Imagerie polarimétrique active infrarouge pour des applications de détection/décamouflage »
Nicolas Vannier1, Corentin Plassart1, Matthieu Boffety1, François Goudail1, Patrick Feneyrou2, Luc Leviandier2, Frédéric Galland3, Nicolas Bertaux3
(1) Laboratoire Charles Fabry, UMR 8501, Institut d'Optique, CNRS, Université Paris Sud 11, Palaiseau
(2) Thales Research and Technology, Palaiseau
(3) Aix-Marseille Université, CNRS, Centrale Marseille, Institut Fresnel UMR 7249, Marseille


« Mesure polarimétrique par brisure d'orthogonalité à travers une fibre multimode »
François Parnet, Julien Fade, Mehdi Alouini
Institut de Physique de Rennes, Université de Rennes 1, CNRS, Rennes

« Diagnostic précoce de l'érosion dentaire par champ de speckle polarisé »
Christelle Abou Nader1,2, Fabrice Pellen1, Philippe Elies3, Bernard Le Jeune1, Guy Le Brun1, Marie Abboud2
(1) Université de Bretagne Occidentale, UEB, EA 938 Laboratoire de Spectrométrie et Optique Laser, IBSAM, Brest
(2) Université Saint Joseph, Département de Physique, Faculté des Sciences, UR TVA, Beirut, Liban
(3) Université de Bretagne Occidentale, UEB, Service PIMM, Brest



17H10-19H00 : SESSION POSTERS - Salle Champetier, ESPCI
Cf. Liste des posters en fin de programme

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Jeudi 17 mars


9H00-9H50 : CONFERENCE INVITEE

« Émission supercritique pour la super-résolution axiale »
Sandrine Leveque-Fort
Institut des Sciences Moléculaires d'Orsay (ISMO), CNRS, Univ. Paris-Sud, Université Paris-Saclay, Orsay
--> Résumé en fin de programme


9H50-10H30 : SUPER-RESOLUTION

« Structured illumination microscopy for micro-structured metallic surfaces »
A. Aguilar1, A. Davila3, N. Faure1, C. Mauclair2
(1) Université Jean Monnet de Saint-Etienne, CNRS UMR5516, Laboratoire Hubert Curien, Saint-Etienne
(2) GIE Manutech-USD, St-Etienne
(3) Centro de Investigaciones en Optica, Leon, Mexico


« Microscopie tomographique diffractive multivue à résolution isotrope »
B. Simon, J. Bailleul, M. Debailleul, O. Haeberlé
Laboratoire MIPS, Université de Haute Alsace, IUT Mulhouse, Mulhouse

10H30-11H00 : PAUSE CAFE - Salle Champetier, ESPCI


11H00-12H00 : CRITERES D'OPTIMISATION & DE PERFORMANCE

« Theoretical derivation of optimal operating frequencies for imaging through turbid media using intensity modulated light »
Swapnesh Panigrahi1, Julien Fade1, Hema Ramachandran2, Mehdi Alouini1
(1) Institut de Physique de Rennes, CNRS, Université de Rennes 1, Rennes
(2) Raman Research Institute, Sadashivanagar, Bangalore, India


« Conception conjointe de l'optique et du traitement d'images appliquée à l'athermalisation d'un objectif infrarouge »
Marie-Anne Burcklen1, Frédéric Diaz1, Joël Rollin1, Mane-Si Laure Lee2, Brigitte Loiseaux2, Hervé Sauer3, François Goudail3
(1) Thales Angénieux, Saint-Héand
(2) Thales Research & Technology France, Palaiseau
(3) Laboratoire Charles Fabry, Institut d'Optique, CNRS, Université Paris Sud 11, Palaiseau


« Analyse de la précision de l'estimation de la hauteur des arbres en Compact PolInSAR avec un modèle simple d'interaction onde-végétation »
Valentine Wasik1, Philippe Réfrégier1, Antoine Roueff1, Pascale C. Dubois-Fernandez2
(1) Aix-Marseille Université, CNRS, Centrale Marseille, Institut Fresnel, UMR 7249, Marseille
(2) Département d'Electromagnétisme et Radar, ONERA, Salon-de-Provence


12H10-14H00 : DÉJEUNER


14H00-14H30 : FOCUS (25 min + 5 min de questions)

« Flux transfer model for designing visual effects by printing »
Mathieu Hébert, Serge Mazauric, Thierry Fournel
Université Jean Monnet de Saint-Etienne, CNRS UMR5516, Laboratoire Hubert Curien, Saint-Etienne


14H30-15H10 : IMAGERIE EN MILIEUX DIFFUSANTS (1)

« Quantification en tomographie optique diffuse résolue en temps »
Judy Zouaoui1, Lionel Hervé1, Laura Di Sieno2, Alberto Dalla Mora2, Andrea Farina2, Antonio Pifferi2, Jacques Derouard3, Jean-Marc Dinten1
(1) Univ. Grenoble Alpes, F-38000 Grenoble, CEA, LETI, MINATEC Campus, F-38054 Grenoble
(2) Politecnico di Milano, Dipartimento di Fisica, Piazza Leonardo da Vinci 32, Milano I-20133, Italy
(3) Univ. Grenoble Alpes, LIPhy, F-38000 Grenoble


« Approche matricielle de la propagation des ondes en milieux complexes : application à l'imagerie à travers des milieux diffusants »
Amaury Badon, Geoffroy Lerosey, Albert Claude Boccara, Mathias Fink, Alexandre Aubry
Institut Langevin, ESPCI ParisTech, PSL Research University, CNRS UMR 7587, Paris

15H10-15H25 : PAUSE


15H25-16H25 : IMAGERIE EN MILIEUX DIFFUSANTS (2)

« Contrôle cohérent spatiotemporel de la lumière dans les milieux multi-diffusants »
M. Mounaix1, D. Andreoli1,2, H. Defienne1, G. Volpe1, O. Katz1,2, S. Gresillon2, S. Gigan1
(1) Laboratoire Kastler Brossel, ENS-PSL Research University, CNRS, Paris
(2) ESPCI ParisTech, PSL Research University, CNRS, Institut Langevin, Paris


« Tomographie optique cohérente plein champ à haute résolution en éclairage par diode électroluminescente »
Jonas Ogien, Arnaud Dubois
Laboratoire Charles Fabry, CNRS UMR 8501, Institut d'Optique Graduate School, Univ. Paris-Sud, Palaiseau

« Imagerie acousto-optique ultrarapide par ondes planes ultrasonores »
Clément Dupuy1, Jean-Baptiste Laudereau1, Alexander Grabar2, Mickaël Tanter1, Jean-Luc Gennisson1, François Ramaz1
(1) Institut Langevin - Ondes et Images, CNRS UMR 7587, ESPCI ParisTech, PSL Research University, UPMC, Paris
(2) Uzhgorod National University, Institute of Solid State Physics and Chemistry, Uzhgorod, Ukraine

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LISTE DES POSTERS

01 - « Imagerie conjointe RGBS couleur et speckle pour la caractérisation de semences végétales »
Étienne Belin1, David Rousseau2, Julio Rojas-Varela1, François Chapeau-Blondeau1
(1) Laboratoire Angevin de Recherche en Ingénierie des Systèmes (LARIS), Université d'Angers, Angers
(2) Université de Lyon, CREATIS, CNRS UMR5220, INSERM U1206, Université Lyon 1, INSA-Lyon, Villeurbanne


02 - « Méthode semi-quadratique et multiplicateurs de Lagrange pour l'imagerie RADAR »
Thomas Benoudiba-Campanini1,2, Pierre Minvielle1, Jean-François Giovannelli2
(1) CEA, DAM, CESTA, Le Barp
(2) Univ. Bordeaux, IMS, UMR 5218, Talence


03 - « Lensfree diffractive tomography for the imaging of 3D cell cultures »
A. Berdeu1,2, F. Momey1,2, T. Bordy1,2, J-M. Dinten1,2, F. Kermarrex Marcel1,3,4, N. Picollet-D'hahan1,3,4, X. Gidrol1,3,4, C. Allier1,2
(1) Univ. Grenoble Alpes, Grenoble
(2) CEA, LETI, MINATEC Campus, Grenoble
(3) CEA, iRTSV-Biologie Grande Echelle, Grenoble
(4) INSERM, U1038, Grenoble


04 - « Contrôle de front d'onde ultra-rapide pour focaliser dans des milieux biologiques »
Baptiste Blochet1,2, David Martina1, Laurent Bourdieu2, Sylvain Gigan1
(1) Laboratoire Kastler Brossel, ENS-PSL Research University, CNRS, UMPC-Sorbonne universités, Collège de France, 24 rue Lhomond, 75005 Paris
(2) ENS-PSL Research University, Institut de Biologie de l'ENS, Inserm, CNRS, Paris

05 - « Surveillance du conducteur et de l'habitacle du véhicule par imageur thermique »
Samuel Bole1,2, Christophe Lavergne1, Corinne Fournier2, Guillaume Druart3, Thierry Lépine2
(1) Renault, Technocentre, Guyancourt
(2) Université Jean Monnet de Saint-Etienne, CNRS UMR5516, Laboratoire Hubert Curien, Saint-Etienne
(4) ONERA, Palaiseau


06 - « The image processing in the context of STED microscopy »
Iván Coto Hernández1, Marco Castello2, Luca Lanzano2, Alberto Diaspro2, Guillaume Dupuis3, Sandrine Leveque-Fort1, Giuseppe Vicidomini2
(1) Institut des Sciences Moléculaires d?Orsay (ISMO), CNRS, Univ. Paris-Sud, Université Paris-Saclay, Orsay
(2) Istituto Italiano di Tecnologia, Genoa, Italy
(3) Université Paris-Sud, Centre de Photonique BioMédicale (CPBM), Fédération LUMAT, CNRS FR 2764, Orsay


07 - « Imagerie cohérente de biospeckle appliquée à l?étude de l?ischémie cérébrale chez le petit animal »
Henri De Maissin, Elisa Cuccione, Denis Bujoreanu, Carole Frindel, Tae-Hee Cho, Fabien Chauveau, David Rousseau
Université de Lyon, CREATIS, CNRS UMR5220, INSERM U1206, Université Lyon 1, INSA-Lyon, Villeurbanne

08 - « Modélisation de speckles polarisés : simulation de champs diffusés par les matériaux via leurs valeurs de décorrélation partielle »
Jan Dupont, Xavier Orlik
ONERA, Theoretical and Applied Optics Department, Toulouse

09 - « Imagerie acousto-optique et reconstruction en milieu fortement diffusant : vers une imagerie quantitative »
Clément Dupuy1,3, Samuel Powell2, Terence Leung3, François Ramaz1
(1) Institut Langevin, Ondes et Images, ESPCI Paris, PSL Research University, CNRS UMR 7587, INSERM
U979, Université Paris VI - Pierre et Marie Curie
(2) Department of Computer Science, University College London, London, UK
(3) Department of Medical Physics and Biomedical Engineering, University College London, London, UK


10 - « Estimation de la profondeur d'une scène par une approche Depth From Focus »
Simon Emberger1,2, Laurent. Alacoque1, Antoine Dupret1, Jean Louis De Bougrenet De La Tocnaye2
(1) CEA 1, 17 Avenue des Martyrs, 38 054 Grenoble
(2) Dpt opt Télécom Bretagne, Plouzané


11 - « Experimental and numerical characterization of the non-linear excitation of a new customized double-clad photonic crystal fiber and gradient index lens »
Ali Ibrahim1, Fanny Poulon1, Remi Habert3, Alexandre Kudlinski3, Darine Abihaidar1,2
(1) IMNC Laboratory, UMR 8165-CNRS, Orsay
(2) University of Paris 7-Paris Diderot, Paris
(3) Univ. Lille, CNRS, UMR 8523 - PhLAM - Physique des Lasers Atomes et Molécules, Lille


12 - « Reconstruction holographique super-résolue par approches inverses alternées »

Frédéric Jolivet1, Nicolas Verrier1,2, Corinne Fournier1, Loïc Denis1, Eric Thiébaut2, Thierry Fournel1
(1) Université Jean Monnet de Saint-Etienne, CNRS UMR5516, Laboratoire Hubert Curien, Saint-Etienne
(2) Université de Lyon, Observatoire de Lyon, CNRS UMR 5574, Centre de Recherche Astrophysique de Lyon, St-Genis Laval

13 - « Amélioration des performances en Full-Field OCT par traitement d'images pour la caractérisation d'un film de polymère »
Paul Montgomery, Audrey Leong-Hoï, Rémy Claveau, Fabien Salzenstein
Laboratoire des Sciences de l'Ingénieur, de l'Informatique et de l'Imagerie (ICube), UDS-CNRS, UMR 7357, Strasbourg

14 - « Structured illumination microscopy and wide field sensorless adaptive optics approach for in vivo Drosophila brain imaging »
Mélanie Pedrazzani1, Vincent Loriette2, Alexandra Fragola2, Daniele Nutarelli1, Thomas Préat3, François Treussart1
(1) Laboratoire Aimé Cotton, CNRS, Université Paris-Sud 11, ENS Cachan, Campus d'Orsay, Orsay

(2) LPEM UMR8213, ESPCI CNRS UPMC, Paris

(3) GDSM, Laboratoire de Neurobiologie, UMR7637, ESPCI, Paris


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RÉSUMÉS DES CONFÉRENCES INVITÉES

Jean-Christophe OLIVO-MARIN
« Mathematical microscopy »
Institut Pasteur, CNRS URA 3691, 75015 ? Paris, France

Important improvements and breakthroughs in microscopy acquisition methods can be achieved by incorporating innovative signal/image processing ingredients directly into the acquisition and/or reconstruction protocols, and by developing the new paradigm of mathematical microscopy. We will present recent work on Structured Illumination Microscopy (SIM) that is based on a Bayesian inverse problem formulation approach that enables the computation of one high-resolution image from a reduced number of low-resolution images and has no specific constraints on the modulation pattern. We will demonstrate the efficiency of this approach through numerical evaluations on simulated data and examples on real microscopy data. Then we will show how compressive sensing can be used as a denoising tool in bioimaging. Multiple reconstructions at low sampling rates are combined to generate high quality denoised images using total-variation sparsity constraints. The validity of the proposed method will be first illustrated on synthetic images with known ground truth and then applied to real biological images.
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Sandrine LEVEQUE-FORT
« Émission supercritique pour la super-résolution axiale »
Institut des Sciences Moléculaires d'Orsay (ISMO), CNRS, Univ. Paris-Sud, Université Paris-Saclay, Orsay

Ces quinze dernières années, la microscopie de fluorescence a connu une véritable révolution grâce aux différentes stratégies permettant de dépasser la limite de diffraction. L'amélioration de la résolution suivant l'axe optique reste cependant un défi majeur. Nous travaillons tout particulièrement à l'amélioration de cette résolution axiale afin de tendre vers un nanoscope permettant d'obtenir une cartographie moléculaire avec une résolution isotrope. En particulier, nous exploitons les propriétés d'émission des fluorophores à proximité de l'Interface lamelle de verre-échantillon biologique, où le champ évanescent des fluorophores peut devenir propagatif. On observe ainsi une émission de fluorescence suivant des angles supérieurs à l'angle critique (Supercritical Angle Fluorescence : SAF). L'émission SAF est donc uniquement associée aux émetteurs situés au voisinage immédiat de l'interface et représente jusqu'à 50% de la fluorescence collectée par la caméra. Comme l'émission SAF décroit de façon exponentielle avec l'éloignement du fluorophore par rapport à l'interface, il est directement possible d'en déduire de façon absolue la position axiale du fluorophore avec une précision nanométrique. Nous présenterons plusieurs implémentations (wide-field, STED, dSTORM) permettant de tirer parti de l'émission SAF ainsi que différentes applications biologiques associées.

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Organisateurs

Comité de programme

Résumés des contributions

Date : du 2016-03-16 au 2016-03-17

Lieu : ESPCI, 10 rue Vauquelin, Paris


Thèmes scientifiques :
B - Image et Vision

Inscriptions closes à cette réunion.

Accéder au compte-rendu de cette réunion.

(c) GdR 720 ISIS - CNRS - 2011-2015.