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Traitement du signal et des images pour la biologie

Nous vous rappelons que, afin de garantir l'accès de tous les inscrits aux salles de réunion, l'inscription aux réunions est gratuite mais obligatoire.

Inscriptions closes à cette réunion.

Inscriptions

38 personnes membres du GdR ISIS, et 16 personnes non membres du GdR, sont inscrits à cette réunion.
Capacité de la salle : 70 personnes.

Instructions pour une demande de mission par le GdR ISIS

Le GdR ISIS prend en charge les déplacements des organisateurs des réunions et des orateurs. Le GdR prend aussi en charge les déplacements des participants aux réunions membres d'un laboratoire adhérent du GdR dans la limite d'un doctorant et d'un permanent par laboratoire académique et par réunion, ou d'une personne par adhérent du club des partenaires et par réunion.

La plus grande partie du budget du GdR ISIS est consacrée à la prise en charge de ces missions. Pour que le GdR puisse financer le plus grand nombre de réunions, les participants à ces réunions sont vivement incités à choisir les billets les moins chers. Seuls les billets de train ou d'avion en deuxième classe, non échangeables et non remboursables sont pris en charge. Le GdR se réserve le droit de refuser une demande de billet dont le prix excède la moyenne des prix couramment pratiqués pour le trajet de la mission.

Pour le transport et pour l'hébergement, vous êtes priés d'utiliser le portail SIMBAD du CNRS si vous en avez la possibilité. Cela est en particulier obligatoire si vous êtes membre d'une unité CNRS (UPR, UMR, UMI, URA, FRE). Les réservations d'hôtel sont possibles si la réunion dure plus d'une journée ou si le lieu d'habitation le justifie. Dans le cas où le laboratoire n'est pas une unité CNRS, merci d'envoyer votre demande de prise en charge de la mission à l'adresse DR01.SoutienUnites@cnrs.fr en précisant que la mission relève du GdR ISIS. Si vous utilisez votre véhicule personnel pour une distance supérieure à 300 kilomètres (aller+retour), le GdR ISIS ne rembourse pas vos frais de transport.

Les demandes de mission et les réservations sur le site SIMBAD doivent impérativement être effectuées au moins deux semaines avant la date de la mission.

Aucun remboursement de frais de transport ou d'hôtel avancés par l'agent ne peut plus être effectué au retour de la mission.

Annonce

La réunion aura lieu le 8 juin 2016, à l'université Paris Descartes (Paris 5).

Lieu : Université Paris Descartes, 45 rue des Saints-Pères, Paris. Département Math&Info, Salle Turing - 7eme étage - Ascenseur 2 ou 3.

Accès par métro : Saint-Germain des Prés Ligne 4 ou Mabillon Ligne 10 ou Rue du Bac Ligne 12

(Cette journée est celle prévue initialement le 9 mars et qui a été reportée).

Description de la journée :

En biologie, et plus généralement dans les sciences du vivant, beaucoup de données sont prises sous forme d'images ou de signaux d'une très grande richesse, pour l'analyse desquels il est de plus en plus nécessaire d'employer des techniques avancées de de traitement du signal et des images.

Par exemple, les décompositions tensorielles sont employées pour de la spectroscopie de flurorescence ou pour améliorer les études en chromatographie, le suivi de particules ou de cellules dans des images biologiques fait largement appel à des méthodes de signal telles qu'on les verrait en radar ou sonar, la spectroscopie et l'imagerie par IRM ont été des motivations mises en avant de développements de certaines méthodes de régularisation de signaux ou d'images (par exemple sous hypothèse de parcimonie), des analyses de la chromatine ou du génome font aussi appel à des techniques évoluées de traitement de signal ou des images.

Plus globalement, toutes les formes d'imagerie en biologie bénéficient des apports de techniques de traitement d'image pour améliorer leur résolution, leur contraste, leur qualité générale...

L'objectif de la journée est de faire un état des avancées récentes des méthodes et techniques de traitement du signal et des images qui sont employées et développées pour l'étude de données en biologie.

Lors de cette journée, nous accueillerons deux présentations invitées pour des exposés tutoriaux :

Cette journée est organisée conjointement avec le GDR MIV : Microscopie et Imagerie du Vivant et accessible aux conditions usuelles aux membres des deux GDR.

Le programme prévisionnel de la jounée est disponible en ligne. Elle débutera à 9h30 et devrait se terminer à 16h40.

Organisateurs :

Programme

R. Bro is performing research on most aspects of chemometrics and in particular on multi-way analysis both from a theoretical and a practical point of view. He is heading an industrial research consortium, ODIN, focusing on Process Analytical Technology (PAT) as well as a new master of science in the same area. He is an editor on Journal of Chemometrics and the author of a number of matlab toolboxes that are made available at www.models.life.ku.dk

Jean-Christophe Olivo Marin is the head of the Quantitative Image Analysis Unit at the Institut Pasteur. He was a co-founder and Chief Technology Officer of the Institut Pasteur Korea, Seoul. He has a long experience of multi-disciplinary approaches in biological imaging, and his research interests are in image analysis of multidimensional microscopy images, pattern recognition and motion analysis for cellular dynamics studies. He is a member of the Bio Imaging and Signal Processing Technical Committee (BISP-TC) of the IEEE Signal Processing Society. In 2016, he was nominated as a Distinguished Lecturer by the IEEE Signal Processing Society.

Résumés des contributions

Date : 2016-06-08

Lieu : Université Paris Descartes, 45 rue des Saints-Pères, Paris. Département Math&Info, Salle Turing - 7eme étage - Ascenseur 2 ou 3.


Thèmes scientifiques :
A - Méthodes et modèles en traitement de signal
B - Image et Vision

Inscriptions closes à cette réunion.

(c) GdR 720 ISIS - CNRS - 2011-2018.