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CDD 36 mois - Chef de projets « pilotage, suivi et déploiement du projet OSIRIS sur l’interopérabilité des données en cancérologie »

1 Septembre 2022


Catégorie : Ingénieur


Le “GrOupe Inter-SIRIC sur le PaRtage et l’Intégration des donnéeS” (OSIRIS) de l’Institut National du Cancer recherche pour son pôle recherche et innovation, le département biologie, transfert et innovations (BTI) :

Un(e) Chef de projets « pilotage, suivi et déploiement du projet OSIRIS sur l’interopérabilité des données en cancérologie » - CDDOD de 36 mois (F/H)

 

L’Institut National du Cancer est un groupement d’intérêt public crée par la loi relative à la santé publique d’août 2004 et constitué en juillet 2005. C’est un opérateur de l’Etat chargé de coordonner les actions de lutte contre le cancer. Il assure un rôle de pilotage et de suivi dans la mise en œuvre de la stratégie décennale 2021-2030. L’Institut travaille dans une logique interdisciplinaire visant à fédérer, décloisonner et mobiliser les acteurs et lesressources autour de projets communs. Il apporte une information adaptée à la population, aux personnes malades et aux professionnels et veille à assurer un continuum entre les soins et la recherche.

A l’ère de la médecine de précision, l’interprétation des données de santé, de nature hétérogène, de quantité et de complexité croissante, nécessite des bases de données structurées et interopérables, qui permettront de mieux stratifier les patients pour la prise en charge de leur cancer.
Le “GrOupe Inter-SIRIC sur le PaRtage et l’Intégration des donnéeS” (OSIRIS) a souhaité relever ce défi à l’échelle nationale. Ce groupe a principalement travaillé sur la structuration des données et l’identification des solutions techniques permettant leur partage. Une liste d’items cliniques et génomiques clés (“set OSIRIS”) a été définie reposant sur des standards internationaux. Ce modèle de données repose sur une représentation modulaire et temporelle des données permettant de suivre l’évolution de la maladie du patient en lien avec les données moléculaires (pour en savoir plus : https://www.e-cancer.fr/Actualites-et-evenements/Actualites/Premiere-publication-du- groupe-inter-SIRIC-OSIRIS-sur-le-partage-et-l-integration-des-donnees-clinico-biologiques-en-cancerologie)

Au sein du pôle recherche et innovation, le département biologie, transfert et innovations (BTI) recherche :

Un(e) Chef de projets « pilotage, suivi et déploiement du projet OSIRIS sur l’interopérabilité des données en cancérologie » - CDDOD de 36 mois (F/H)

Rattaché(e) à la responsable du département Biologie, transfert et innovations et en interaction directe avec la Direction de l’observation des sciences des données et de l’évaluation de l’Institut, votre mission consistera à :

Pour la partie technique :

  • Maintenir et mettre à jour les modèles existants (clinique et radiomique) en fonction des mises à jour des référentiels associés et des corrections à faire ;

  • Développer des outils d’alignement des modèles vers des référentiels internationaux ainsi que des outils de validation des formats de données OSIRIS et en assurer la maintenance ;

  • Revoir les items/terminologies en fonction des évolutions des modèles ;

  • Rédiger et mettre à jour toute la documentation technique et fonctionnelle publique relative au projet (gestion du GitHub OSIRIS : https://github.com/siric-osiris/OSIRIS) ;

  • Coordonner la révision du profilage FHIR des versions corrigées.

    Pour la partie pilotage du projet :

  • Piloter et animer des groupes de travail pour l’inclusion de nouveaux domaines fonctionnels (ex : radiothérapie, radiomique, etc) et modéliser les propositions émanant des groupes de travail ;

  • S’assurer de la cohérence du modèle OSIRIS lors de l’intégration des nouveaux domaines ;

  • Préparer une méthodologie de validation en vue d’un endossement par l’Institut des nouveaux sets proposés ;

  • Gérer le recueil des propositions d’évolution ou implémentation des sets OSIRIS par des tiers ;

  • S’assurer de la cohérence des travaux menés dans le cadre des autres initiatives de la Plateforme de données en cancérologie de l’INCa (https://www.e-cancer.fr/Expertises-et-publications/La-plateforme-de-donnees- en-cancerologie), des autres initiatives nationales et européennes sur le partage et l’interopérabilité des données pour la recherche en cancérologie ;

  • Coordonner les démarches juridiques en relation avec les conditions d’utilisation du modèles et sets OSIRIS ;

  • Définir une stratégie de promotion et de communication du projet OSIRIS et la mettre en œuvre ;

  • Répondre aux sollicitations externes relatives au déploiement du modèle OSIRIS ;

  • Accompagner les équipes de recherche qui sollicitent l’utilisation du modèle OSIRIS pour leurs projets de

    recherche ;

  • Assurer une veille scientifique et technologique et de toutes les initiatives s’appuyant sur OSIRIS pour les projets de recherche et/ou pour la structuration des données au niveau des institutions de recherche/établissements de santé.

    Profil recherché :

    Vous êtes titulaire d’un diplôme scientifique avec une double compétence en biologie et en informatique/data science (Bac + 5 minimum). Vous avez pu acquérir une expérience en modélisation de la connaissance, une expérience en programmation de type Python, Java, PHP (et frameworks associés) ainsi qu’une expérience en gestion de développement/déploiement : Git/Gitlab, Docker.

    Pour ce poste très challengeant et riche, des connaissances en bases de données : MySQL, PostgreSQL ou autres technologies « No SQL », de standards internationaux associés aux données de santé (ICD, SNOMED, ATC, ...) ou encore de l’écosystème lié à l’interopérabilité en santé (FHIR, OMOP) sont attendues.

    Savoirs :

  • Compréhension des concepts d’ingénierie et de science des données ;

  • Connaissance des bonnes pratiques de sécurité et de protection des données personnelles ;

  • Connaissances de la recherche clinique, du système de santé, des acteurs de terrain et des institutions sanitaires seraient un plus ;

  • Niveau d’anglais scientifique courant nécessaire.

    Savoir-faire :

  • Expérience significative en gestion de projets (cadrage, pilotage, etc) dans le secteur de la santé ou un secteur technologique ;

  • Capacité à mobiliser un réseau d’interlocuteurs, à gérer, coordonner, animer des groupes de travail, à gérer les conflits et les situations complexes ;

  • Qualités d’organisation, de planification et de rigueur ;

  • Capacité à se saisir de nouveaux sujets et à monter en compétences rapidement : prise d’initiative,

    autonomie ;

  • Esprit d’analyse et de synthèse et qualités rédactionnelles ;

  • Pédagogie, clarté de présentation.

    Savoir-être :

    • Esprit d’équipe et d’initiative, attitude proactive, constructive et collaborative

    • Aptitude et goût pour le travail pluridisciplinaire

    • Qualités de communication et sens des relations humaines

 

Dans le cadre de ce poste, vous serez amené à travailler en contact direct avec une grande diversité d’acteurs de l’écosystème des données de santé en cancérologie. Vous collaborerez ainsi avec :

- des profils techniques, tels que des bio-informaticiens, data scientists ou des data ingénieurs ;

- des acteurs de l’écosystème public de la donnée de santé dans tous ses aspects, comme des chercheurs, cliniciens, juristes, et des acteurs des systèmes d’informations hospitaliers.

Des déplacements pour rencontrer les équipes impliquées sont à prévoir.

 

Pour postuler :

Merci de bien vouloir transmettre votre candidature (CV et lettre de motivation) par mail à

recrutement@institutcancer.fr

Poste en CDDOD de 36 mois à temps plein à pourvoir dès que possible. Poste soumis à l’obligation de déclaration publique d’intérêts.