Ingénieur d'étude en traitement d'image

1 Septembre 2023

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Catégorie : Ingénieur

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Type : CDD de 1 an à compter du 1er octobre 2023, renouvelable

Fonctions : Ingénieur d’étude en traitement d'image

Localisation :Laboratoire I3S UMR 7271 à Sophia Antipolis
Plateforme de Microscopie PIM de l’Institut de la Mer de Villefranche/Mer (IMEV)

Contact: sebastien.schaub@imev-mer.fr

Laure Blanc-Féraud : blancf@i3s.unice.fr

Luca Calatroni : calatroni@i3s.unice.fr

Mission :

Dans le cadre d’un projet de recherche en technique de super-résolution, l’équipe Morphème a développé et publié plusieurs algorithmes basés sur la fluctuation de fluorescence. La mission de l'ingénieur d'étude recruté sur contrat européen, est d’assurer un déploiement de ces outils auprès d’utilisateurs finaux (biologistes) sur des plateformes de microscopie.

La mission de l’ingénieur sur ce projet européen sera de développer des plugins et des macros sous ImageJ en Java et sous Napari en Python à partir de programmes écrits en Matlab ou Python. Il/Elle testera régulièrement sur la plateformes PIM les programmes développés et avoir les remontées des utilisateurs. Il/Elle sera directement en contact avec les chercheurs ayant développé les méthodes de super-résolution de l’équipe Morpheme. Il/Elle aura à assurer la transmission entre l’équipe-développement (I3S - Morpheme) et la PIM pour permettre l’utilisation des algorithmes développés par des utilisateurs finaux non-expert.

Activités principales :

• Comprendre les méthodes et programmes déjà développées en Matlab ou Python
• Ecrire les programmes en java et en Python
• Faire les Plugins et les macros nécessaires pour être utilisables facilement sous ImageJ et Napari
• Ecrire les programmes pour que les méthodes soient robustes et tout automatique et « user-friendly »
• Mettre en place des critères numériques de qualités et des méthodes de tests
• Tester les plugins dans divers environnements et pour différents types de données.

Connaissances :

• Méthodes de traitements numériques des images de base
• Méthodes d’estimation et d’optimisation de base
• Langue anglaise : Anglais technique (connaissance générale)

Compétences:

• Programmation en java, Python
• Tester et debugger un programme

• Savoir-faire : Travailler en équipe, savoir planifier et respecter des délais,
• Savoir-être : Rigueur / Fiabilité, sens de l'organisation, capacité d'écoute

Diplôme réglementaire exigé :

• Licence
• Domaine de formation souhaité : traitement du signal et des images