Réunion
Journées d'imagerie optique non conventionnelle - 9e édition
Thèmes scientifiques :
- B - Image et Vision
Nous vous rappelons que, afin de garantir l'accès de tous les inscrits aux salles de réunion, l'inscription aux réunions est gratuite mais obligatoire.
Inscriptions
51 personnes membres du GdR ISIS, et 50 personnes non membres du GdR, sont inscrits à cette réunion.
Capacité de la salle : 100 personnes.
Annonce
Plus que jamais, le domaine de l’imagerie optique se situe au carrefour de plusieurs disciplines, tant du point de vue de la conception des systèmes, mêlant physique, conception optique et traitement des images, qu'en termes d'applications: biomédical, télédétection, astronomie, ...
Les « Journées Imagerie Optique Non-Conventionnelle » (JIONC) visent à réunir les acteurs (chercheurs et ingénieurs) de ces différents domaines, afin d'échanger sur les plus récents développements de systèmes ou de traitements pour l'imagerie « non-conventionnelle » et d’évaluer leurs applications potentielles.
Bien qu’organisées dans la continuité des éditions précédentes, les JIONC évoluent néanmoins en 2014 en se dotant d'un comité d'organisation et d'un comité de programme renouvelés, visant toujours à refléter la diversité thématique des communautés de l'imagerie optique et du traitement du signal/image.
Cette année, nous accueillerons deux présentations invitées données par :
- Valentina Emiliani (Laboratoire Neurophysiologie et Nouvelles Microscopies - Université Paris-Descartes) sur la mise en forme de front d'onde pour l'optogénétique.
- Max Langer (Laboratoire Creatis, Lyon - ESRF, Grenoble) sur les développements et applications de la tomographie de phase en imagerie X.
Nous sollicitons des propositions de communications de nature théorique et applicative, provenant des milieux académiques et industriels, sur les thèmes suivants (liste non exhaustive) :
- Modalités d'imagerie avancées : imagerie hyperspectrale, polarimétrique, acoustique/multi-ondes, holographique, interférométrique, multimodale, thermique, téraHertz, radar, optique de l’extrême (X-UV)…
- Imagerie biomédicale : microscopie, OCT, imagerie multi-photonique, super-résolution, imagerie dans les milieux diffusants, …
- Conception d'imageurs innovants : compressed sensing, imagerie 3D, haute résolution, co-conception…
- Méthodes de traitement des images issues de ces différents capteurs : débruitage, déconvolution, compression, tracking, segmentation, détection/classification, séparation de sources, …
- Problèmes inverses en imagerie : holographie, reconstruction de phase, tomographie, …
- Applications de ces systèmes d’imagerie : télédétection, contrôle industriel, défense, astronomie, sciences du vivant.
Merci de nous faire parvenir vos propositions (max. 1 page par résumé), par courrier électronique, avant le 1er février 2014.
aux coordonnées suivantes :
- Corinne Fournier, Laboratoire Hubert-Curien, Saint-Étienne.
corinne.fournier@univ-st-etienne.fr, Tel.: 04 69 66 32 61 - Julien Fade, Institut de Physique de Rennes, Rennes.
julien.fade@univ-rennes1.fr, Tel.: 02 23 23 52 15 - Matthieu Boffety, Institut d’Optique Graduate School, Palaiseau.
matthieu.boffety@institutoptique.fr, Tel.: 01 64 53 32 98
Comité de programme
- Brasselet Sophie, Institut Fresnel, Marseille
- Champagnat Frédéric, Onéra DTIM (Département Traitement de l'Information et Modélisation), Palaiseau
- Devlaminck Vincent, LAGIS (Laboratoire d'Automatique, Génie Informatique et Signal), Lille
- Fort Emmanuel, Institut Langevin, Paris
- Goudail François, Institut d'Optique Graduate School, Palaiseau
- Kervrann Charles, INRIA, Rennes
- Lantz Éric, Institut Femto-ST, Besançon
- Marzani Franck, Le2i (Laboratoire Electronique, Informatique et Image), Dijon
- Réfrégier Philippe, Institut Fresnel, Marseille
- Rousseau David, CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé), Lyon
- Simon Bertrand, Laboratoire MIPS (Modélisation, Intelligence, Processus et Systèmes), Mulhouse
- Thiebaut Éric, CRAL (Centre de Recherche Astrophysique de Lyon), Lyon
- Tourneret Jean-Yves, IRIT (Institut de Recherche en Informatique de Toulouse), Toulouse
Programme
Durée pour chaque contribution orale : 15 min + 5 min questions
Mercredi 19 mars
10H-10H45 : CONFERENCE INVITEE
« Phase retrieval in X-ray in-line phase tomography - developments and applications »
Max Langer CREATIS,
Univ. Lyon 1, CNRS, INSERM, Lyon European Synchrotron Radiation Facility (ESRF), Grenoble
10H45-12H05 : IMAGERIE HAUTES-ENERGIES
« A new microscopy for imaging crystalline properties in 3D at the nanoscale: Bragg X-ray ptychography »
V. Chamard, M. Allain
Institut Fresnel, CNRS, Aix-Marseille Université, Ecole Centrale Marseille, Marseille
« Tomographie de phase par rayonnement synchrotron appliquée à la détection de nanoparticules dans le cerveau »
H. Rositi, C. Frindel1, M. Langer1,2, M. Wiart1, C. Olivier1,2, F. Peyrin1,2, D. Rousseau1
(1) CREATIS, Univ. Lyon 1, CNRS, INSERM, Lyon
(2) European Synchrotron Radiation Facility (ESRF), Grenoble
« Phase retrieval in Bragg-diffraction ptychography: noise models and reconstruction algorithms »
M. Allain1, P. Godard1;2, A. Pateras1, F. Mastropietro1, V. Chamard1
(1) Institut Fresnel, CNRS, Aix-Marseille Université, Ecole Centrale Marseille, Marseille
(2) Université de Poitiers, CNRS, ENSMA, Institut P', UPR 3346, Poitiers
« Bimodalité en tomographie Compton »
G. Rigaud1, R. Régnier2, M. K. Nguyen2
(1) Institute of Applied Mathematics, Saarland University, Saarbrücken, Germany
(2) ETIS - ENSEA/Université de Cergy-Pontoise/CNRS (UMR 8051), Cergy-Pontoise
12h05-14h00 : DEJEUNER
14H00-15H20 : TOMOGRAPHIE DIFFRACTIVE ET HOLOGRAPHIE NUMERIQUE
« Microscopie Tomographique Diffractive en reflexion et profilométrie multiangles »
L. Hui, J. Bailleul, B. Simon, M. Debailleul, B. Colicchio, O. Haeberle
Laboratoire MIPS, Universite de Haute Alsace, Mulhouse
« Microscopie Tomographique Diffractive résolue en polarization : vers une résolution sub lambda/4 »
C. Godavarthi1, T. Zhang1, G. Maire1, H. Giovannini1, P. C. Chaumet1, A. Talneau2, K. Belkebir1, A. Sentenac1
(1) Institut Fresnel, CNRS, Aix-Marseille Université, Ecole Centrale Marseille, Marseille
(2) Laboratoire de Photonique et de Nanostructures, CNRS, Marcoussis
« Stochastic near field 3D microscopy using Brownian metallic nanoparticles »
A. Martinez-Marrades1, N. Bardou2, S. Collin2, M. Gross3, F. Kanoufi4,5, G. Tessier1,6
(1) Institut Langevin, ESPCI ParisTech, CNRS, Université Pierre et Marie Curie, Paris
(2) Laboratoire Photonique et Nanostructures (LPN-CNRS), Marcoussis
(3) Laboratoire Charles Coulomb-UMR, 5221 CNRS-UM2, Université Montpellier II, Montpellier
(4) Univ. Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, ITODYS, UMR CNRS 7086, Paris
(5) ESPCI ParisTech, Paris
(6) Neurophotonics Laboratory, CNRS UMR 8250, University Paris Descartes, Paris
« Visualisation des courants de convection dans une ampoule par interférométrie holographique image et numérique »
J-M. Desse1, P. Picart2
(1) ONERA The French Aerospace Lab, Lille
(2) LUNAM Université, Université du Maine, CNRS UMR 6613, LAUM, Le Mans
15H20-16H40 : PROBLEMES INVERSES
« Une nouvelle approche régularisée pour la reconstruction de phase »
A. Repetti, E. Chouzenoux, J-C. Pesquet
Equipe signal et communication, LIGM, Université de Marne-la-Vallée
« Approche Bayésienne pour l'optimisation de la Microscopie par Illumination Structurée »
F. Orieux1, E. Sepulveda2, V. Loriette3, J.-C. Olivo-Marin4, A. Fragola3
(1) IAP, CNRS, Paris
(2) IN2P3, Paris VI, Paris
(3) LPEM, CNRS, ESPCI-Paris-Tech, Paris
(4) QIAU, Institut Pasteur, CNRS
« Approche Bayésienne faiblement régularisée pour la super-résolution en microscopie de fluorescence basée sur la diffraction conique »
J. Caron1, C. Fallet1, J-Y. Tinevez2, L. Moisan3, L. Philippe (Ori) Braitbart1, Gabriel Y. Sirat1 and Spencer L. Shorte2
(1) Bioaxial SAS, Paris
(2) PFID, Imagopole, Institut Pasteur, Paris
(3) Universite Paris Descartes, Laboratoire MAP5, Paris
« Contrôle de front-d’onde extrême pour l’imagerie astronomique à haute dynamique : premiers résultats experimentaux »
B. Paul1,3, J-F. Sauvage1,2, L. Mugnier1, D. Mouillet2, K. Dohlen3, T. Fusco1,3, M. Ferrari3
(1) Onera The French Aerospace Lab, Châtillon
(2) Institut de Planétologie et d’Astrophysique de Grenoble
(3) Laboratoire d’Astrophysique de Marseille
16h40-... -- PAUSE CAFE ET 1ERE SESSION POSTERS
Jeudi 20 mars
8h45-9h30 -- CONFERENCE INVITEE
« Wave front shaping and optogenetics »
Valentina Emiliani
Wave front engineering microscopy group, Neurophotonics Laboratory, CNRS UMR8250, Paris Descartes University, Paris
9h30-10h50 -- NOUVEAUX CONCEPTS EN IMAGERIE I
« Vidéo-microscopie sans lentille appliquée à l'étude de cultures 2D de cellules »
O. Cioni, F. Momey, S. V. Kesavan, J.-G. Coutard, F. Navarro, C.P. Allier, J.-M. Dinten
CEA, Leti, Campus Minatec, Grenoble
« Laser Doppler holographic microscopy in transmission: in-vivo imaging of zebrafish embryo »
N. Verrier1,2, D. Alexandre1 , M. Gross2
(1) Laboratoire Hubert Curien, UMR CNRS-5516 Université Jean Monnet, Saint-Etienne
(2) Laboratoire Charles Coulomb, UMR CNRS-5221 Université de Montpellier II, Montpellier
« Polarimetrie de Mueller déportée par fibre optique »
S. Manhas1, J. Vizet1, S. Deby2, J.-C. Vanel2, A. De Martino2, D. Pagnoux1
(1) Institut Xlim, département photonique, Limoges, France
(2) LPICM, UMR CNRS 7647, Ecole Polytechnique, Palaiseau
« Améliorer la vivisilité en imagerie photoacoustique en utilisant une illumination structurée aléatoirement »
J. Gateau, T. Chaigne, O. Katz, S. Gigan, E. Boissy
Institut Langevin, ESPCI ParisTech, CNRS UMR 7587, INSERM U979, Paris
10h50-12h10 -- PAUSE CAFE ET 2E SESSION POSTERS
12h10-14h00 -- DEJEUNER
14h00-15h40 -- IMAGERIE HYPER- ET MULTI-SPECTRALE
« Système hyperspectral pour la visualisation rehaussée de tissus vitaux en imagerie interventionnelle »
D.Nouri, Y. Lucas, S. Treuillet
Laboratoire PRISME, Université d'Orleans, Orléans
« Modélisation de la réponse hyperspectrale des matrices de détecteurs infrarouges »
S. Mouzali, S. Lefebvre
ONERA The French Aerospace Lab, Palaiseau
« Hyperspectral Image Classification Using Sparse Representations of Morphological Attribute Profiles »
M. Dalla Mura1, S. Benqin2, J. Li3, P. Li2, A. Plaza3, J. Bioucas Dias4, J.A. Benediktsson5, J. Chanussot1
(1) Grenoble Institute of Technology (INP Grenoble), GIPSA-Lab, Grenoble
(2) Peking University, Institute of Remote Sensing and GIS, China
(3) University of Extremadura, Dpt. of Technology of Computers and Communications, Spain
(4) Instituto de Telecomunicacoes, Electro. and Comp., Portugal
(5) University of Iceland, Engineering Research Institute, Iceland
« Tomographie par cohérence optique plein champ multi-bandes sur une plage spectrale s'étendant de 530nm à 1700nm »
A. Federici, A. Dubois
Laboratoire Charles Fabry, CNRS UMR 8501, Institut d'Optique Graduate School, Univ. Paris-Sud, Palaiseau
15h40-17h00 -- NOUVEAUX CONCEPTS EN IMAGERIE II
« Reconstruction 3D des faces externes et internes d'objets transparents par polarimétrie »
F. Drouet, C. Stolz, O. Laligant, O. Aubreton
Le2i, Université de Bourgogne, UMR CNRS 6306, Le Creusot
« Evaluation des performances des techniques de profilométrie de surface par des mesures multi-modales et marquage sur silicium »
P.C. Montgomery1, M. Guellil1, P. Pfeiffer1, B. Serio2
(1) Laboratoire des Sciences de l'Ingénieur, de l'Informatique et de l'Imagerie (ICube), Unistra-CNRS, UMR 7357, Strasbourg
(2) Laboratoire Energétique, Mécanique, Electromagnétisme (LEME), Université Paris Ouest Nanterre La Défense, Ville d'Avray
« Mapping the radiative and non-radiative local density of states with a fluorescent scanning near-field probe »
D. Cao1, A. Cazé1, M. Calabrese1, R. Pierrat1, N. Bardou2, S. Collin2, R. Carminati1, V. Krachmalnicoff1, Y. De Wilde1
(1) Institut Langevin, ESPCI ParisTech, CNRS UMR 7587, Paris
(2) Laboratoire de Photonique et Nanostructures (LPN-CNRS), Marcoussis
« Un imageur compressé utilisant les milieux multiplement diffusants »
A. Liutkus1, D. Martina1, S. Popoff1, G. Chardon2, O. Katz1, G. Lerosey1, S. Gigan1, L. Daudet1, I. Carron3
(1) Institut Langevin, ESPCI ParisTech, CNRS UMR 7587, Paris
(2) Acoustics Research Institute, Vienna, Austria
(3) TEES SERC, Texas A&M University, USA
Posters
S. Meimon1, J. Jarosz1,2, J. M. Conan1, M. Paques2
(1) ONERA, Chatillon
(2) Quantel Medical, Cournon d'Auvergne (3) Centre Investigation clinique 503, INSERM, Hôpital des Quinze-Vingts, Paris
C. Lefort1,2, H. Hamzeh1,5, F. Louradour2,3, F. Pain1,5 and D. Abi Haidar1,4
(1) Laboratoire IMNC, UMR 8165- Université Paris-Sud Orsay
(2) Université de Limoges, Limoges
(3) Laboratoire XLIM, UMR 7252, Limoges
(4) Université Paris 7-DENIS DIDEROT, Paris
(5) Université Paris Sud Orsay, Orsay
P. Gasecka, F.-Z. Bioud, H. Rigneault, P. Ferrand, J. Duboisset, S. Brasselet
Institut Fresnel, CNRS, Aix-Marseille Université, Ecole Centrale Marseille, Domaine Universitaire St Jérôme, Marseille
Alberto Aguilar1,2 , Abundio Dávila1, Jorge García-Márquez3, Cyril Mauclair2
(1) Centro de Investigaciones en Optica, León, México
(2) Laboratoire Hubert Curien, UMR 5516 CNRS, Université Jean Monnet, Saint Etienne
(3) Laboratoire Commun de Métrologie LNE/CNAM, Paris
T. Frachon3,4, L. Weber1,2, B. Hesse1,2, P. Dong1,2, S. Rit1,2, F. Peyrin1,2, M. Langer1,2
(1) Créatis, CNRS UMR5220, Inserm U1044, INSA-Lyon, Université Lyon 1, Villeurbanne.
(2) European Synchrotron Radiation Facility (ESRF), Grenoble
(3) LMGP, UMR 5628, Grenoble INP, Minatec, Grenoble
(4) EVEON SAS, Montbonnot Saint-Martin
L. Weber1,2, M. Langer1,2, P. Cloetens2, F. Peyrin1,2
(1) Créatis, CNRS UMR5220, Inserm U1044, INSA-Lyon, Université Lyon 1, Villeurbanne
(2) European Synchrotron Radiation Facility (ESRF), Grenoble
R. Fezzani1,2, P. Cornic2, G. Le Besnerais2, C. Kulcsar1
(1) ONERA The French Aerospace Lab, Palaiseau
(2) Laboratoire Charles Fabry, Institut d'Optique Graduate School, CNRS, Univ. Paris-Sud, Palaiseau
Igor Carron
TEES SERC, Texas A&M University, USA.
S. Liu, F. Galland, N. Bertaux
Aix Marseille Université, CNRS, Centrale Marseille, Institut Fresnel, UMR 7249, Marseille
N. Verrier , C. Fournier , L. Denis , T. Fournel
Laboratoire Hubert Curien, UMR CNRS-5516 Université Jean Monnet, Saint-Etienne
J. Bailleul, L. Hui, B. Simon, M. Debailleul, B. Colicchio, O. Haeberle
Laboratoire MIPS EA2332, Universite de Haute Alsace, Mulhouse
T. Chaigne, O. Katz, J. Gateau, C. Boccara, M. Fink, E. Bossy, S. Gigan
Institut Langevin, ESPCI, Paris
M. Vallet1, F. Varray1, B. Montcel1, J. Boutet2, D.Vray1
(1) CREATIS, CNRS UMR5220, Inserm U1044, INSA-Lyon, Université Lyon 1
(2) CEA-LETI, MINATEC, Grenoble
O. Simandoux1, I.N. Papadopoulos2, S. Farahi2, J.P. Huignard1, D. Psaltis2, C. Moser2 et E. Bossy1
(1) Institut Langevin, ESPCI, CNRS UMR 7587, INSERM ERL U979, 75005 Paris
(2) School of Engineering, Ecole Polytechnique Fédéral de Lausanne (EPFL), Lausanne, Suisse
A. Grebenyuk1 , A. Federici2, V. Ryabukho1,3, A. Dubois2
(1) Department of Optics and Biophotonics, Saratov State University, Saratov, Russia
(2) Laboratoire Charles Fabry, Institut d'Optique Graduate School, CNRS UMR 8501, Université Paris-Sud, Palaiseau
(3) Institute of Precision Mechanics and Control, Russian Academy of Sciences,Saratov, Russia
F. Peragut, J.-B. Brubach, P. Roy, Y. De Wilde
Institut Langevin, ESPCI ParisTech, CNRS, Paris
T. Grulois1, G. Druart1, N. Guérineau1, A. Crastes2
(1) ONERA The French Aerospace Lab, Palaiseau
(2) ULIS, ZI Les Iles Cordées, Veurey-Voroize
J. Restrepo1,2 , and I. Ihrke1,2
(1) INRIA Bordeaux Sud-Ouest
(2) Laboratoire Photonique, Numérique et Nanosciences, Institut d'Optique Graduate School, Univ. Bordeaux 1
A. Ghabbach, M. Zerrad, G. Soriano, C. Amra
Institut Fresnel, CNRS UMR 7249, Aix Marseille Université, Ecole Centrale Marseille, Marseille
J. Dupont1, X. Orlik1, A. Ghabbach2, M. Zerrad2, G. Soriano2, C. Amra2
(1) ONERA The French Aerospace Lab, Toulouse
(2) Institut Fresnel, CNRS UMR 7249, Aix Marseille Université, Ecole Centrale Marseille, Marseille
J. Fade, S. Panigrahi, M. Alouini
Institut de Physique de Rennes, Université de Rennes 1, CNRS, Rennes
S. Panigrahi1, J. Fade1, A. Carré1, C. Hamel1, L. Frein1, F. Bretenaker2, H. Ramachandran3, M. Alouini1
(1) Institut de Physique de Rennes, Université de Rennes 1, CNRS, Rennes
(2) Laboratoire Aimé Cotton, CNRS, Université Paris-Sud 11, Orsay
(3) Raman Research Institute, Bangalore, India
Résumés des contributions
EXPOSES INVITES
Max Langer
CREATIS, Univ. Lyon 1, CNRS, INSERM, Lyon
European Synchrotron Radiation Facility (ESRF), Grenoble
Valentina Emiliani
Wave front engineering microscopy group, Neurophotonics Laboratory, CNRS UMR8250, Paris Descartes University, Paris
The combination of light microscopy and optogenetics offers the possibility to control activation and inhibition of neuronal activity enabling the analysis of well-defined neuronal population within intact neuronal circuits and systems. Interestingly, optogenetics has already permitted to address key biological questions with relatively simple illumination methods using widefield visible light illumination. However, some limitations in the specificity of genetic targeting and the intricate morphology of the brain make it challenging to, for example, individuate subsets of genetically identical interconnected cells, or to establish the role of specific spatiotemporal excitatory patterns in guiding animal behavior. To reach such degree of specificity, more sophisticated illumination methods are required. Here we present a new method for high-resolution two photon optogenetics based on the temporal control of ultrafast pulses for axial localization of the illumination volume and on either digital holography or the generalized phase contrast method for lateral light patterning. We apply sculpted two-photon illumination to activate ChR2 in cultured neurons and cortical slices with sufficient efficacy to reliably fire action potentials with millisecond temporal resolution and low excitation power. Finally, we investigate the propagation of temporally focused patterned beams through thick fixed and acute brain slices and demonstrate that both axial resolution and lateral light shape of temporally focused beams are impressively robust to scattering.